当地方性法规与部门规章对同一事项的规定不一致，不能确定如何适用时，下列处理程序正确的有（ ）。

根据《立法法》规定，地方性法规与部门规章之间对同一事项的规定不一致，不能确定如何适用时，由国务院提出意见。国务院认为应当适用地方性法规的，应当决定在该地方适用地方性法规的规定；认为应当适用部门规章的，应当提请全国人民代表大会常务委员会裁决。因此，A、B、C正确。D错误，因为并非直接由全国人大常委会裁决，需先经国务院提出意见。E错误，因为国务院不能直接决定适用部门规章，需提请全国人大常委会裁决。