在工程质量监督工作中，监督机构可以采取的措施包括（ ）。

选项A正确，查阅资料是基础监督手段。选项B正确，现场检查是重要手段。选项C正确，责令改正是常用措施。选项D错误，监督机构无权直接替换材料，应由施工单位处理。选项E正确，对于严重问题，责令停工是必要的行政监督措施。