在评标过程中，评标委员会发现不同投标人的投标文件由同一单位或者个人编制，应当否决其投标。

根据《招标投标法实施条例》第四十条规定，不同投标人的投标文件由同一单位或者个人编制的，视为投标人相互串通投标。对于视为串通投标的情形，评标委员会应当否决其投标。