在单价合同中，若招标工程量清单中某项工程的工程量偏差超过15%，且该工程量变化使该项工程的综合单价发生变化时，其综合单价应予以调整，但工程量仍按实际完成的工程量计算。

根据《建设工程工程量清单计价规范》，当工程量偏差超过15%时，超过部分的综合单价应予以调整，以防止因工程量大幅变化导致的不公平。同时，结算工程量仍按实际完成的工程量计算，这是单价合同的基本计量原则。