在材料设备采购合同中，若卖方交付的材料数量少于合同约定，但短缺比例在5%以内，且合同未约定具体处理方式，监理工程师应建议买方按实际数量验收并扣减相应货款，无需追究卖方违约责任。

虽然短缺比例较小可能不影响使用，但卖方交付数量不足仍构成违约。监理工程师应建议买方按实结算，但同时应保留向卖方主张违约责任（如违约金或赔偿损失）的权利，不能简单认定为“无需追究违约责任”。