某施工招标项目，评标委员会在详细评审阶段发现下列情况，其中应当否决投标的有（ ）。

选项A，投标函未盖章，属于签字盖章不全，应当否决。选项B，工期长于规定，属于未响应实质性要求，应当否决。选项C，拒绝确认修正，视为不响应或程序违规，应当否决。选项D，联合体协议未明确牵头人，可能导致责任主体不清，若招标文件要求明确，则属于未响应或协议缺失关键要素，通常视为否决情形（或视为未提交有效协议）。选项E，业绩材料缺少复印件，若招标文件要求必须提供且作为资格审查或详细评审依据，可能否决，但相比前四项，E的否决依据更多取决于招标文件的具体规定。而A、B、C、D更贴近法定或通用评标办法中的硬性否决条款。故选ABCD。