专项施工方案经论证后结论为“修改后通过”的，施工单位应当根据论证报告修改完善，并经（ ）签字确认后，方可组织实施。

根据《危险性较大的分部分项工程安全管理规定》，专项施工方案经论证后需修改的，施工单位应当根据论证报告修改完善，并经施工单位技术负责人、总监理工程师签字确认后，方可组织实施。项目负责人和项目技术负责人无权单独签字确认此环节，建设单位项目负责人也不在此签字流程中。因此正确答案为BC。