某工程施工招标项目，招标文件规定评标办法采用经评审的最低投标价法。在评标过程中，评标委员会发现某投标人的投标文件中“技术方案”部分存在重大缺陷。根据规定，该投标人应当由招标人决定是否接受。

根据《招标投标法实施条例》第五十一条，投标文件没有对招标文件的实质性要求和条件作出响应的，评标委员会应当否决其投标。技术方案存在重大缺陷，属于未对实质性要求作出响应，应直接判定为无效投标，而非由招标人决定是否接受。