某监理单位与某施工单位存在长期合作关系，并在该监理单位任职的监理工程师持有该施工单位的股份。这种情况主要违反了工程监理的（ ）。

独立性要求监理单位及其人员与被监理对象（施工单位）无经济利益关联。持有施工单位股份属于直接的经济利益冲突，严重破坏了监理的独立性。虽然这也可能导致无法公平处理问题，但根源在于独立性丧失。